它重複感染的特性，會讓資訊人員有處理不完的事件。從2007年以Kavo為首的USB病毒開始危害個人電腦時，我們測試了兩種自動處理的程式，但可能也是因為病毒會自我更新，還是無法完全清除，不過這些已能處理大部分問題。 需注意的是，USB病毒會隨著explorer.exe一起運作，執行前要先停止explorer.exe，我們建議開機時以「安全模式」處理，避免病毒利用網路更新程式。另外，目前做法僅限於解決現行USB病毒，若USB病毒持續利用網路更新、演化，所有方法可能也無法解決，所以要記得建立預防機制，避免災情擴大。 目前Kavo Killer及USBCleaner是網路上針對USB病毒開發的程式，都能免費使用，如果只是單一臺電腦中毒，也可以使用這個程式。 USBCleaner是由中國人所開發的程式，處理效果不錯，而且還能修復異常機碼、偵測USB儲存裝置及啟發式掃描功能，還有auto.exe掃毒工具，能找出許多隱藏於電腦系統中的USB病毒資料。不過這種程式主要是偵測病毒名稱，一旦名稱改變就無法掃描，所以需要時常更新解毒程式，才能因應新種病毒的威脅 。 為此，Kavo Killer的作者還開發自行解決的解毒程式，如果你知道電腦被特定類型的USB病毒攻擊，並能自行分析出程式名稱及路徑，就可以自己打造專用解毒程式。
